Im Einzelfall kann der Genuss von Wein bei Menschen mit Immunschwächen allergische Reaktionen auslösen, z. B. Hautjucken, Schwellungen und Atembeschwerden. Das wahrscheinlich häufigste Allergen ist Protein, das nach der Gärung und nach dem Abstich von der Hefe im Wein in geringen Mengen vorhanden ist. Aber auch Histamin kann Allergien verstärken. Histamin ist ein Eiweißbaustein, der in bestimmten Rotweinen vorkommt, wenn auch in sehr geringen Mengen. Bei einer Histaminunverträglichkeit muss der Konsument auf andere Weine ausweichen. In sehr seltenen Fällen kann auch eine Unverträglichkeit gegenüber der schwefligen Säure, die allen Weinen in geringen Mengen zur Konservierung zugesetzt wird, Ursache einer Allergie sein.